MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 plasmid pDRPIS7493

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015876	T	6	6	30	35	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015876	ACT	2	6	49	54	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015876	TGA	2	6	104	109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015876	CA	3	6	118	123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015876	TCA	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015876	GAG	2	6	186	191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015876	ATGA	2	8	225	232	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015876	A	6	6	304	309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015876	GAA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015876	CAA	2	6	388	393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015876	TTTG	2	8	428	435	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015876	GTC	2	6	640	645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015876	AGG	2	6	646	651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015876	GAT	2	6	690	695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015876	GA	3	6	708	713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015876	A	6	6	724	729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015876	TGG	2	6	739	744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015876	TAGA	2	8	784	791	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015876	GAA	2	6	816	821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015876	GAC	2	6	883	888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015876	TGT	2	6	908	913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015876	TCAA	2	8	934	941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015876	AAG	2	6	976	981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015876	AAG	2	6	1129	1134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015876	AG	3	6	1167	1172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015876	TTG	2	6	1346	1351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015876	AAGC	2	8	1371	1378	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015876	AGG	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015876	GT	3	6	1576	1581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015876	TAGC	2	8	1584	1591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015876	A	6	6	1594	1599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015876	TGA	2	6	1641	1646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015876	ACT	2	6	1651	1656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015876	TTG	3	9	1658	1666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015876	CGGT	2	8	1747	1754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015876	A	6	6	2057	2062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015876	A	6	6	2079	2084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015876	A	6	6	2101	2106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015876	A	6	6	2123	2128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015876	TAA	2	6	2130	2135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015876	TA	3	6	2162	2167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015876	A	6	6	2180	2185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015876	AGC	2	6	3116	3121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015876	TGA	2	6	3129	3134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015876	TCTT	2	8	3169	3176	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015876	GAA	2	6	4001	4006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015876	A	6	6	4011	4016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015876	TG	3	6	4042	4047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015876	T	6	6	4106	4111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015876	A	6	6	4149	4154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015876	A	6	6	4192	4197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015876	T	7	7	4218	4224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015876	CT	3	6	4258	4263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015876	AAGTA	2	10	4294	4303	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015876	TTATA	2	10	4311	4320	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015876	CTAG	2	8	4358	4365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015876	GAG	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015876	CAAA	2	8	4542	4549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015876	TG	3	6	4686	4691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015876	ATT	2	6	4700	4705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015876	T	7	7	4720	4726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.